Video: Paano pinagsama ang mga contig sa mga plantsa?
2024 May -akda: Miles Stephen | [email protected]. Huling binago: 2023-12-15 23:41
Kapag gumagawa ng draft genome, ang mga indibidwal na pagbabasa ng DNA ang una binuo sa contigs , na, sa pamamagitan ng likas na katangian ng kanilang pagpupulong , may gaps sa pagitan nila. Ang susunod na hakbang ay sa pagkatapos ay tulay ang mga puwang sa pagitan ng mga ito contigs to gumawa ng plantsa . Magagawa ito gamit ang alinman sa optical mapping o mate-pair sequencing.
Katulad nito, maaari mong itanong, ano ang contigs at scaffolds?
A plantsa ay isang bahagi ng genome sequence na na-reconstruct mula sa end-sequenced whole-genome shotgun clone. Mga plantsa ay binubuo ng contigs at gaps. A contig ay isang magkadikit na haba ng genomic sequence kung saan ang pagkakasunud-sunod ng mga base ay kilala sa isang mataas na antas ng kumpiyansa. Sa ibang Pagkakataon, plantsa maaaring mag-overlap.
Gayundin, ano ang contigs sa bioinformatics? A contig (mula sa magkadikit) ay isang set ng magkakapatong na mga segment ng DNA na magkakasamang kumakatawan sa isang consensus na rehiyon ng DNA. Contigs sa gayon ay maaaring sumangguni sa magkasanib na pagkakasunud-sunod ng DNA at sa magkakapatong na mga pisikal na segment (mga fragment) na nasa mga clone depende sa konteksto.
Sa bagay na ito, paano ang mga contigs ay binuo?
Ang hanay ng magkakapatong na pagkakasunud-sunod ng DNA ng mga fragment ng DNA ay kilala bilang a contig . Contig Ang pagmamapa ay isang proseso kung saan ang mga magkakapatong na clone ay tipunin sa pagkakasunud-sunod na overlap. Kabilang dito ang pagsasaayos ng contigs sa kaayusan at oryentasyon. I-clone contigs maaaring awtomatiko tipunin gamit ang kanilang BAC-end sequence.
Bakit mahalaga ang contigs?
Contig ang pagpupulong ay isang mahalaga hakbang sa genome assembly. Para sa pagmamapa, ang mga magkakapatong na clone ay pinagsama-sama sa pagkakasunud-sunod na nagsasapawan. Ang bawat fragment ay na-clone sa isang vector at pinagsunod-sunod mula sa magkabilang dulo upang makabuo ng haba ng pagkakasunud-sunod na humigit-kumulang 600–700 bp. Ang pagkakasunud-sunod mula sa magkabilang dulo ng fragment ng DNA ay tinatawag na pares na dulo.
Inirerekumendang:
Paano mo pinagsama ang mga inductor?
Mga Bahagi ng Electronics: Pagsamahin ang mga Inductors sa Serye o sa Mga Parallel Series na inductors: Idagdag lang ang halaga ng bawat indibidwal na inductor. Dalawa o higit pang magkaparehong parallel inductors: Idagdag ang mga ito at hatiin sa bilang ng mga inductors. Dalawang parallel at hindi pantay na inductors: Gamitin ang formula na ito:
Nangyayari ba ang mga reaksiyong kemikal kapag pinagsama ng mga proton ang mga atomo?
Ang mga atomo ng mga molekula ay pinagsama-sama sa pamamagitan ng isang reaksyon na kilala bilang chemical bonding. Atomic na istraktura ng carbon atom na nagpapakita ng mga particle ng isang atom: proton, electron, neutrons. Kapag ang isang hydrogen atom ay nawalan ng solong elektron nito
Ano ang hitsura ng DNA na nauugnay ang kemikal na istraktura nito sa hitsura nito kapag maraming mga ito ay pinagsama-sama?
Iugnay ang kemikal na istraktura nito sa hitsura nito kapag marami sa mga ito ay pinagsama-sama. Ang DNA ay mukhang spider webs. Ang DNA ay natutunaw sa DNA extraction buffer kaya hindi namin ito makita. Kapag hinalo ito sa ethanol, nagkumpol ito at bumuo ng mas makapal at mas makapal na mga hibla na sapat na malaki upang makita
Paano unang binago ng mga tao ang mga pananim Anong paraan ang ginagamit ng mga siyentipiko ngayon upang baguhin ang mga pananim?
Mula sa mga pipino at karot hanggang sa puting bigas at trigo, binago nating mga tao ang mga gene ng halos bawat pagkain na ating kinakain. Ngayon ang mga siyentipiko ay mabilis na makakagawa ng pagbabago sa pamamagitan ng pagpili ng isang gene na maaaring magresulta sa isang nais na katangian at pagpasok ng gene na iyon nang direkta sa chromosome ng isang organismo
Paano pinagsama-sama ang mga cell?
Ang mga multicellular organism ay mga organismo na binubuo ng higit sa isang uri ng cell at may mga espesyal na selula na pinagsama-sama upang magsagawa ng mga espesyal na function. Ang magkatulad na mga cell ay pinagsama-sama sa mga tisyu, ang mga grupo ng mga tisyu ay bumubuo ng mga organo, at ang mga organo na may katulad na function ay pinagsama-sama sa isang organ system