Ano ang Pcoa?

2024 May -akda: Miles Stephen | [email protected]. Huling binago: 2023-12-15 23:41

PCoA ay isang paraan ng scaling o ordinasyon na nagsisimula sa isang matrix ng pagkakatulad o pagkakaiba sa pagitan ng isang set ng mga indibidwal at naglalayong gumawa ng isang mababang-dimensional na graphical na plot ng data sa paraang ang mga distansya sa pagitan ng mga punto sa plot ay malapit sa mga orihinal na dissimilarities.

Katulad nito, ano ang pagsusuri ng PCoA?

Principal Coordinates Pagsusuri ( PCoA , = Multidimensional scaling, MDS) ay isang paraan upang galugarin at mailarawan ang mga pagkakatulad o hindi pagkakatulad ng data. Nagsisimula ito sa isang similarity matrix o dissimilarity matrix (= distance matrix) at nagtatalaga para sa bawat item ng lokasyon sa isang low-dimensional na espasyo, hal. bilang isang 3D graphics.

Alamin din, ano ang balangkas ng ordinasyon? Ang coenocline ay isang graphical na representasyon ng lahat ng mga function ng pagtugon ng mga species sa isang komunidad na naka-plot sa isang solong environmental gradient. Dahil sa malaking bilang ng mga species at mataas na ingay sa karamihan ng mga pag-aaral, ang mga coenocline ay karaniwang ipinapakita lamang sa napakasimpleng anyo.

Pangalawa, ano ang pagkakaiba ng PCA at PCoA?

Habang PCA ay batay sa mga distansyang Euclidean, PCoA kayang humawak ng (dis)similarity matrice na kinakalkula mula sa quantitative, semi-quantitative, qualitative, at mixed variables. Gaya ng nakasanayan, ang pagpili ng (dis) na sukat ng pagkakatulad ay kritikal at dapat na angkop sa data na pinag-uusapan.

Ano ang non metric multidimensional scaling?

Hindi - metric multidimensional scaling (NMDS) ay isang hindi direktang gradient analysis approach na gumagawa ng ordinasyon batay sa isang distansya o dissimilarity matrix. Ang anumang dissimilarity coefficient o sukat ng distansya ay maaaring gamitin upang buuin ang distance matrix na ginamit bilang input. Ang NMDS ay isang rank-based na diskarte.