Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng 16s rRNA at 18s RRNA?
Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng 16s rRNA at 18s RRNA?

Video: Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng 16s rRNA at 18s RRNA?

Video: Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng 16s rRNA at 18s RRNA?
Video: mRNA, tRNA, and rRNA function | Types of RNA 2024, Nobyembre
Anonim

Pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng pagsasagawa ng mga pagsusuri na may 18S rRNA data ng gene sa halip na 16S rRNA Ang data ng gene (o data ng ITS) ay ang sangguniang database na ginagamit para sa pagpili ng OTU, ang mga takdang-aralin sa taxonomic, at ang pagbuo ng pagkakahanay na nakabatay sa template, dahil dapat itong maglaman ng mga eukaryotic sequence.

Isinasaalang-alang ito, bakit ang 16s rRNA gene ay ginagamit para sa pagkakakilanlan?

Ang 16S ribosomal RNA gene mga code para sa bahagi ng RNA ng 30S subunit ng bacterial ribosome. Dahil sa pagiging kumplikado ng DNA-DNA hybridization, 16S rRNA gene ang sequencing ay ginamit bilang kasangkapan sa kilalanin bacteria sa antas ng species at tumulong sa pagkakaiba sa pagitan ng malapit na nauugnay na bacterial species [8].

Bilang karagdagan, ang mga eukaryote ba ay may 16s rRNA? Ang 16S rRNA gene ay naroroon sa lahat ng bakterya, at ang isang kaugnay na anyo ay nangyayari sa lahat ng mga cell, kabilang ang sa eukaryotes.

Tanong din, ano ang 18s at 28s rRNA?

Ang 28S / 18S ribosomal RNA Ang ratio ay madalas na ginagamit upang masuri ang kalidad ng kabuuang RNA na nalinis mula sa anumang ibinigay na sample. Sa mga tao, 28S rRNA ay may ~5070 nucleotides, at 18S ay mayroong 1869 nucleotides, na nagbibigay ng a 28S / 18S ratio ng ~2.7. Isang mataas 28S / 18S Ang ratio ay isang indikasyon na ang purified RNA ay buo at hindi nasira.

Ano ang 16s rRNA sequencing?

16S rRNA gene pagkakasunod-sunod Ang pagsusuri ay isang karaniwang pamamaraan sa bacterial taxonomy at pagkakakilanlan, at batay sa pagtuklas ng pagkakasunod-sunod mga pagkakaiba (polymorphism) sa mga hypervariable na rehiyon ng 16S rRNA gene na naroroon sa lahat ng bakterya.

Inirerekumendang: